More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1910 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1910  ABC transporter related protein  100 
 
 		 372 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00585985  normal  0.967307 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.99 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  43.18 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  44.75 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.73 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  41.98 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 352 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.2 
 
 		 353 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  41.98 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  41.72 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.7 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  38.91 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  49.79 
 
 		 341 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  49.62 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  48.12 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  48.12 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  36.76 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.59 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  39.54 
 
 		 366 aa  232  6e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.77 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  41.56 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.12 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  46.37 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.9 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  41.72 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  48.12 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  40.8 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  39.39 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  40.88 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  43.37 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  39.43 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  54.75 
 
 		 343 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  42.73 
 
 		 353 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 360 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  42.9 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  39.77 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  49.79 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  40.74 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.69 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.12 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  48.95 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  48.95 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  47.5 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  48.54 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  46.28 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  48.54 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.94 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.61 
 
 		 364 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.36 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.79 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.79 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  48.54 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  38.5 
 
 		 386 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.64 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  40.19 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.92 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.5 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 395 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  42.38 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  41.21 
 
 		 374 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 		 376 aa  225  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.05 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  49.57 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  37.43 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  45.53 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.56 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  39.51 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  38.87 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.08 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>