More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1557 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1557  ribosomal protein L31  100 
 
 		 82 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0965465  decreased coverage  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4370  ribosomal protein L31  78.75 
 
 		 85 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.0154955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36470  LSU ribosomal protein L31P  75.61 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  70.73 
 
 		 86 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2901  50S ribosomal protein L31 type B  70.73 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  71.6 
 
 		 81 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11640  LSU ribosomal protein L31P  65.85 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04220  LSU ribosomal protein L31P  66.67 
 
 		 90 aa  116  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1654  50S ribosomal protein L31P  71.83 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0758  hypothetical protein  62.96 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  61.54 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000143826  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4415  ribosomal protein L31  71.6 
 
 		 83 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000833435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  63.41 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  62.2 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02360  50S ribosomal protein L31 type B  60 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  60 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  58.75 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  64.63 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  58.75 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  52.44 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0233  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000024812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5333  50S ribosomal protein L31 type B  62.96 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  57.69 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  58.02 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6211  ribosomal protein L31  57.83 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2094  ribosomal protein L31  58.02 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00123067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21720  LSU ribosomal protein L31P  69.23 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3270  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 80 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  53.66 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  57.5 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  57.69 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  59.26 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000664047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000768356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  56.41 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  55.56 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000392946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1470  ribosomal protein L31  67.95 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0295752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 81 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000131175  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  54.32 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_002950  PG0592  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5129  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000037521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  55.13 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  53.85 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  53.85 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  53.85 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1566  ribosomal protein L31  51.22 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1857  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316845  normal  0.0801388 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  55.13 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11228  50S ribosomal protein L31  54.32 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0234  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0913753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  57.69 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000944485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  52.56 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0614  ribosomal protein L31  49.37 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0125  ribosomal protein L31  55 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000012592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  54.32 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1540  50S ribosomal protein L31 type B  53.85 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.267597  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  53.09 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17700  50S ribosomal protein L31 type B  52.56 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  52.56 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 		 83 aa  88.6  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0109  50S ribosomal protein L31 type B  49.38 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0526  ribosomal protein L31  49.37 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2197  ribosomal protein L31  46.91 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2261  50S ribosomal protein L31P  45.68 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1281  50S ribosomal protein L31P  46.99 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1539  50S ribosomal protein L31 type B  45.68 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2900  ribosomal protein L31  46.91 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4797  ribosomal protein L31  49.38 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168745  normal  0.0677805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4909  ribosomal protein L31  48.78 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.665913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2635  50S ribosomal protein L31P  46.91 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00389942  normal  0.0577596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2807  ribosomal protein L31  45 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3920  50S ribosomal protein L31 type B  47.56 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4183  ribosomal protein L31  47.56 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2363  50S ribosomal protein L31P  48.15 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0169896  normal  0.930447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>