17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4951 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4951  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  29.74 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  26.51 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  22.92 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  24.26 
 
 
254 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  24.89 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  25.45 
 
 
292 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  25.2 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  26.75 
 
 
211 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  26.07 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  22.69 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  24.89 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  22.69 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  22.69 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  26.47 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5835  DivIVA domain protein  27.89 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  23.38 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>