More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4871 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4871  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 517 aa  993    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 522 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  35.54 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1434  MFS family transporter  35.29 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  30.82 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.37 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 528 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 531 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.23 
 
 		 454 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.88 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.33 
 
 		 467 aa  170  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  32.54 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 		 488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.14 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 478 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.77 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4511  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0561268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  26.68 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 520 aa  158  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 609 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.81 
 
 		 487 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 466 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 763 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 541 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 613 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 493 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.19 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.84 
 
 		 497 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 512 aa  150  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 646 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 646 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 487 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 495 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
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NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 		 627 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
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NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 516 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
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NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.29 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 		 493 aa  146  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
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