More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3886 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  40.35 
 
 		 2137 aa  1188    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1953  Beta-ketoacyl synthase  40.09 
 
 		 2081 aa  1142    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3886  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2014 aa  3947    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.190721 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  45.94 
 
 		 2287 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  45.94 
 
 		 2338 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  45.94 
 
 		 2258 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  45.94 
 
 		 2273 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3261  beta keto-acyl synthase  45.94 
 
 		 2262 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  45.94 
 
 		 2294 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1395  putative polyketide synthase  45.94 
 
 		 2285 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 2762 aa  204  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  27.35 
 
 		 2396 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 		 1656 aa  199  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.99 
 
 		 1587 aa  198  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  30.11 
 
 		 2882 aa  198  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.72 
 
 		 1939 aa  196  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  35.16 
 
 		 2386 aa  195  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 		 4478 aa  195  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  35.08 
 
 		 7149 aa  195  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 1272 aa  195  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 		 3693 aa  194  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  33.9 
 
 		 2553 aa  194  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 		 3693 aa  194  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.57 
 
 		 3008 aa  194  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 3702 aa  194  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.04 
 
 		 3099 aa  192  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.49 
 
 		 1832 aa  192  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.71 
 
 		 1909 aa  192  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  32.98 
 
 		 2189 aa  190  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.32 
 
 		 3527 aa  189  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.2 
 
 		 3679 aa  189  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 2772 aa  189  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  31.32 
 
 		 1717 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  33.4 
 
 		 2503 aa  187  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  30.06 
 
 		 1087 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.72 
 
 		 249 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  33.7 
 
 		 2439 aa  188  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 		 2551 aa  187  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  32.95 
 
 		 3176 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  34.18 
 
 		 2674 aa  186  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  29.11 
 
 		 2393 aa  186  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.14 
 
 		 3696 aa  185  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.05 
 
 		 3243 aa  185  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 		 2880 aa  184  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  34.28 
 
 		 2103 aa  183  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  29.5 
 
 		 5612 aa  183  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0187  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 259 aa  183  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  32.9 
 
 		 2107 aa  183  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.1 
 
 		 2230 aa  183  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.48 
 
 		 950 aa  182  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 		 3115 aa  182  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  30.08 
 
 		 2232 aa  181  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.53 
 
 		 2249 aa  181  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  31.34 
 
 		 2298 aa  181  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  33.14 
 
 		 3254 aa  180  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.62 
 
 		 249 aa  180  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  32.02 
 
 		 1304 aa  181  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 2477 aa  180  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.96 
 
 		 1822 aa  181  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 7110 aa  179  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  29.15 
 
 		 2391 aa  179  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  27.78 
 
 		 2276 aa  179  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 		 3099 aa  179  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.51 
 
 		 2376 aa  179  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.8 
 
 		 2260 aa  179  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  32.82 
 
 		 2188 aa  179  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  30.68 
 
 		 3130 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  34.22 
 
 		 1071 aa  177  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  37.72 
 
 		 2176 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.16 
 
 		 3645 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.15 
 
 		 2314 aa  177  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  32.51 
 
 		 4649 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 3676 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3899  Beta-ketoacyl synthase  30.96 
 
 		 1748 aa  176  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  31.29 
 
 		 1812 aa  175  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 5154 aa  175  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  31.67 
 
 		 2719 aa  175  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  45 
 
 		 2454 aa  175  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  30.42 
 
 		 1696 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.47 
 
 		 2348 aa  175  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  32.21 
 
 		 7210 aa  174  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.97 
 
 		 1804 aa  174  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  34.59 
 
 		 3148 aa  174  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  31.41 
 
 		 4080 aa  174  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  32.89 
 
 		 4580 aa  174  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.83 
 
 		 2136 aa  174  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  32.89 
 
 		 4123 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  32.89 
 
 		 4122 aa  174  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  32.89 
 
 		 4101 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 		 1190 aa  174  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 		 2201 aa  174  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 		 1190 aa  174  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  32.89 
 
 		 4098 aa  174  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  32.89 
 
 		 4157 aa  173  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 1190 aa  173  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  32.74 
 
 		 3670 aa  173  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  33.04 
 
 		 3427 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  31.99 
 
 		 4183 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  31.04 
 
 		 3930 aa  172  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  31.03 
 
 		 5778 aa  172  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>