19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3001 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  51.35 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.93 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  49.56 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  42.98 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  49.02 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  48.51 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  42.59 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.63 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  42.11 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  40.17 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  40.16 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  32.98 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0207  hypothetical protein  37.25 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>