More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2105 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2105  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000146734  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.2 
 
 		 495 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.9 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.13 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  43.89 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 494 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.55 
 
 		 517 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  46.73 
 
 		 497 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.94 
 
 		 496 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  41.99 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 515 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.75 
 
 		 505 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 515 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 515 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  41.54 
 
 		 503 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  42.17 
 
 		 508 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 508 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.35 
 
 		 492 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 515 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 515 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 522 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 525 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.9 
 
 		 501 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 511 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.03 
 
 		 503 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 496 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.09 
 
 		 520 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.17 
 
 		 509 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.26 
 
 		 501 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.16 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 		 504 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.27 
 
 		 521 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.49 
 
 		 506 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 		 506 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 		 506 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.66 
 
 		 499 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 		 506 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0822  ABC transporter related  39.43 
 
 		 502 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.688061  hitchhiker  0.00171866 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  41.81 
 
 		 502 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.63 
 
 		 507 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 514 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.8 
 
 		 506 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 507 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  37.8 
 
 		 506 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  40.13 
 
 		 501 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 		 519 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 494 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  42.77 
 
 		 512 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 494 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 494 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.32 
 
 		 507 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.81 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 506 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  39.35 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.53 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.95 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.13 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0817  galactoside ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.552008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 494 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  44.98 
 
 		 529 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  44.48 
 
 		 509 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.02 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.77 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.14 
 
 		 501 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 501 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 516 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  39.5 
 
 		 525 aa  242  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.74 
 
 		 513 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.47 
 
 		 514 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.71 
 
 		 497 aa  242  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  44.25 
 
 		 500 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  40.82 
 
 		 520 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>