179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2008 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2008  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
320 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401214  decreased coverage  0.000173677 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.68 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.69 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  30.34 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  32.14 
 
 
644 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  37.01 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.41 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.71 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  26.69 
 
 
509 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.57 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  33.81 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  33.33 
 
 
497 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.46 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  21.91 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  20.72 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  30.67 
 
 
412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  33.14 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  30.67 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  30.67 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  30.67 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25.97 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  30.67 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  30.67 
 
 
315 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  33.58 
 
 
305 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  34.68 
 
 
511 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.52 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.28 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  24.3 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  32.05 
 
 
456 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  20.75 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.9 
 
 
721 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  31.51 
 
 
501 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  29.9 
 
 
223 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  30.61 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29610  esterase/lipase  38.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.545384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  30 
 
 
497 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  37.88 
 
 
442 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.77 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  33.33 
 
 
503 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  39.39 
 
 
222 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.81 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.14 
 
 
339 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  32.85 
 
 
496 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  30.4 
 
 
525 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  34.29 
 
 
502 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  34.29 
 
 
520 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.65 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  25.91 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  25.82 
 
 
795 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  21.31 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  31.95 
 
 
520 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.81 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.36 
 
 
641 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.26 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  36.59 
 
 
496 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  29.32 
 
 
553 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.01 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4309  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.22 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29600  esterase/lipase  32.56 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 
645 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  31.82 
 
 
324 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  22.05 
 
 
303 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  35.19 
 
 
221 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  32.17 
 
 
507 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  32.79 
 
 
506 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  32.91 
 
 
321 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.45 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31.76 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0134  esterase/lipase-like protein  22.71 
 
 
303 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.396672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  24.17 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.53 
 
 
319 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  34.86 
 
 
502 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  27.91 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  27.54 
 
 
218 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.68 
 
 
789 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  34.86 
 
 
502 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  31.76 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  34.86 
 
 
502 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  33.81 
 
 
506 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2788  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.67 
 
 
340 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.985478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  28.83 
 
 
201 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  30.73 
 
 
841 aa  45.8  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  30.59 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  26.64 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  35.24 
 
 
529 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  33.94 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.11 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  29.13 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.16 
 
 
750 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  32.38 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  32.38 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.16 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  34.86 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>