21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0732 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0732  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  196  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.147899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4802  hypothetical protein  68.09 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4888  hypothetical protein  68.09 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5189  hypothetical protein  68.09 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221064  decreased coverage  0.0000618918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5404  hypothetical protein  61.7 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0595  hypothetical protein  69.57 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13686  hypothetical protein  63.04 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.34573e-46  normal  0.1222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0217  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0316  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201172  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4418  hypothetical protein  54.72 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4036  hypothetical protein  50.94 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0049  hypothetical protein  47.92 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3905  hypothetical protein  60 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0125  hypothetical protein  53.19 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00206742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5867  hypothetical protein  52.38 
 
 
42 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.539151  normal  0.215251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1979  hypothetical protein  49.21 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0488  hypothetical protein  48 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3369  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0622  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0123  hypothetical protein  41.67 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33330  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.592597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>