38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0524 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0524  protein of unknown function DUF1089  100 
 
 
194 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0163  protein of unknown function DUF1089  33.5 
 
 
207 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13787  hypothetical protein  33.69 
 
 
199 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4051  protein of unknown function DUF1089  30.85 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5597  hypothetical protein  32.98 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5344  hypothetical protein  30.48 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4963  hypothetical protein  30.48 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.601635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4072  hypothetical protein  34.39 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5051  hypothetical protein  30.48 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.622775  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4530  hypothetical protein  35.14 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5622  hypothetical protein  36.77 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1141  hypothetical protein  34.05 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1211  hypothetical protein  31.82 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4678  hypothetical protein  35.48 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376007  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3690  hypothetical protein  35.48 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4015  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.700649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0307  protein of unknown function DUF1089  29.63 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0317  protein of unknown function DUF1089  32.16 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103976  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4875  protein of unknown function DUF1089  31.75 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000355198  normal  0.582407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4603  protein of unknown function DUF1089  34.16 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3366  hypothetical protein  32.14 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000501118  hitchhiker  0.0000000000000170165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1188  hypothetical protein  27.72 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0444931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2999  hypothetical protein  31.89 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1793  hypothetical protein  30.16 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0982203  hitchhiker  0.0000201517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1312  hypothetical protein  32.24 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0568  hypothetical protein  32.24 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0294  hypothetical protein  32.24 
 
 
279 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0164483  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2515  hypothetical protein  31.58 
 
 
410 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1333  hypothetical protein  31.58 
 
 
277 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.349732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3293  hypothetical protein  31.07 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1260  hypothetical protein  31.33 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.928683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2652  hypothetical protein  27.66 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3300  hypothetical protein  30.41 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38720  hypothetical protein  30.41 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0025  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1479  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4571  hypothetical protein  28.74 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1824  protein of unknown function DUF1089  28.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00397249  normal  0.0794049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>