12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0070 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0070  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  283  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0019  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0189767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0018  hypothetical protein  34.92 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.681504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4994  hypothetical protein  43.75 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1681  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4480  hypothetical protein  37.32 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00280  hypothetical protein  30.23 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.326036  normal  0.0617221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8341  hypothetical protein  35.51 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.724069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10010  hypothetical protein  35.19 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0030  hypothetical protein  40.28 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>