76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0476 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0476  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000249939  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-His-1  tRNA-His  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0209  tRNA-His  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.524642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0049  tRNA-His  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  91.49 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0119  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0557096  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0095  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0011  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0032  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0037  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0513  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2183  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0510  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.228812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0008  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0019  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0061  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0037  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.57043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0016  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t04  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0598  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0602  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1735  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000539085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1739  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000050357  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1157  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00434161  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1161  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0179935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1590  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0985046  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2179  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2218  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2260  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.177016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0017  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.547674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>