More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0225 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0225  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 417 aa  849    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000489158  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  46.06 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  44.55 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  46.89 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  44.31 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  46.17 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  45.69 
 
 		 430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  46.17 
 
 		 448 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  45.69 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  46.17 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  45.22 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 430 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  44.66 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  44.58 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  43.71 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  44.52 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 430 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 		 432 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  44.34 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  44.34 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  43.71 
 
 		 430 aa  349  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  43.94 
 
 		 457 aa  348  9e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  44.87 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  44.1 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  44.42 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  43.84 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  43.68 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 		 437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  43.23 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  42.48 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  43.44 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  40 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  42.55 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  42.35 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  43.39 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  43.13 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  43.82 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  41.18 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  43.22 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  42.08 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  42.25 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  43.13 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  42.52 
 
 		 430 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  41.04 
 
 		 431 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 431 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  42.24 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  41 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  39.43 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  42.47 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  41.55 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  40.24 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  41.65 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  40.65 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 		 431 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 		 431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  41 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  40.66 
 
 		 432 aa  308  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>