More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0058 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0058  ribosomal protein S15  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0324884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  55.95 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  52.94 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  53.57 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  52.38 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  52.94 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  51.81 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  48.78 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  50.59 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 		 89 aa  87  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  47.06 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  48.78 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  51.76 
 
 		 89 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  48.78 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  47.06 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  50 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  44.71 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  47.06 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  50.6 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  50.6 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  50.6 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  48.24 
 
 		 89 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  50.6 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  47.56 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  49.41 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  47.06 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  50.59 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  43.53 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  51.76 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  47.06 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  50.62 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  49.38 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  45.24 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  51.22 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  44.71 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  48.24 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  45.24 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  48.24 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  50.59 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  47.06 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  44.71 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  47.62 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  44.19 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  48.24 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  49.4 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  47.62 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  48.81 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  49.38 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  47.62 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  48.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  46.43 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  48.24 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>