37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0039 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0039  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0754168  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0280  RNA polymerase, omega subunit  47.37 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0796  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.62 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1857  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.07 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0490453  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1303  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  25.64 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.116648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2446  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.07 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0530  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.13 
 
 		 98 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0090  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.5 
 
 		 91 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.92 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0377  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2281  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.5 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.69 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4177  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00539722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0044  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2577  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001863  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  45 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3528  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.55 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408605  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02820  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.68 
 
 		 87 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03458  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5021  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3860  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4128  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3958  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4067  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4021  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4100  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3984  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0062  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4152  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03506  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0056  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45 
 
 		 91 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>