More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05861 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  98.61 
 
 		 431 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  100 
 
 		 465 aa  943    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  63.19 
 
 		 481 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  63.96 
 
 		 416 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  60.24 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  57.01 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  59.31 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  56.03 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  57.64 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  54.85 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.26 
 
 		 301 aa  253  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 302 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  41.96 
 
 		 302 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  42.96 
 
 		 295 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 302 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  42.31 
 
 		 304 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  40.28 
 
 		 284 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  39.79 
 
 		 292 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  37.32 
 
 		 367 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  35.88 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  35.88 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  38.01 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  35.47 
 
 		 369 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 341 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  34.88 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  34.83 
 
 		 343 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 		 367 aa  193  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  34.86 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  34.88 
 
 		 284 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  34.49 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  36.21 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  36.61 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  35.49 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  36.27 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  34.32 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  31.62 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  30.93 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.97 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.97 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.55 
 
 		 687 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  28.92 
 
 		 686 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.54 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.32 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.02 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  29.12 
 
 		 598 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  26.07 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  30.45 
 
 		 720 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 587 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  30.63 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.62 
 
 		 694 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 378 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  28.15 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  32.93 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.75 
 
 		 736 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  28.79 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  26.71 
 
 		 672 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  27.04 
 
 		 529 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  27.19 
 
 		 619 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.79 
 
 		 672 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.41 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  28.29 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  27.15 
 
 		 591 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  28.29 
 
 		 678 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  27.88 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  26.84 
 
 		 596 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  27.88 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  28.68 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  29.51 
 
 		 579 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  27.17 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  28.02 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  27.52 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  27.91 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  29.38 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  30.47 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  27.63 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  27.17 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  27.74 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  27.64 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  28.02 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  27.38 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  27.63 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  27.24 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  27.24 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  27.24 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  27.63 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  28.12 
 
 		 644 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  28.4 
 
 		 496 aa  107  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  26.74 
 
 		 599 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  27.63 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  28.46 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  26.99 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  26.67 
 
 		 592 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  26.67 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>