More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00581 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 871 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 875 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 874 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 886 aa  1076    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 867 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 863 aa  728    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 884 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 880 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 876 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 880 aa  986    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 874 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 874 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 880 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 880 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 880 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 874 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 860 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 860 aa  684    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 899 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 887 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 871 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 892 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  98.08 
 
 		 886 aa  1793    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 874 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 886 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 878 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 880 aa  978    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.12 
 
 		 873 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 931 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 876 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 882 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 897 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 886 aa  1071    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 899 aa  1070    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 872 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2518  alanyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 889 aa  1051    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 876 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 880 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 864 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 880 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 874 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 886 aa  1074    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 899 aa  1009    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 862 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 881 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 874 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 905 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 874 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  52.37 
 
 		 906 aa  862    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 876 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 875 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 859 aa  638    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 874 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 863 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 874 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 874 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 892 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 868 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 874 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 890 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 884 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 880 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 871 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 874 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 897 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 865 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 875 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 903 aa  676    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 897 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 874 aa  983    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 874 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 869 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 874 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 880 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 886 aa  1084    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 874 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 930 aa  1093    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 897 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 885 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 878 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 875 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00581  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1820    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 878 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 860 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 885 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 900 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 867 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 876 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>