16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3880 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3878  hypothetical protein  43.12 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2675  hypothetical protein  43.84 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3491  hypothetical protein  41.67 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3554  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3504  hypothetical protein  41.2 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00743821  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  34.78 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4460  putative lipoprotein LppH  28.51 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13609  lipoprotein lppH  30.32 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.736478  normal  0.52125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3244  putative lipoprotein LppH  27.73 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3233  putative lipoprotein LppH  27.73 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.662281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3295  putative lipoprotein LppH  27.73 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2235  putative lipoprotein LppH  26.11 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4738  putative lipoprotein LppH  27.46 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12431  lipoprotein lppR  28.21 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2107  LpqA  53.06 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>