12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2414 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2143  hydrogen:quinone oxidoreductase  87.75 
 
 		 1797 bp  1485    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2189  hydrogen:quinone oxidoreductase  87.75 
 
 		 1797 bp  1485    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.269515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2414    100 
 
 		 3163 bp  6270    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058415  normal  0.231807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2130  hydrogen:quinone oxidoreductase  87.54 
 
 		 1797 bp  1461    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638664  normal  0.0209583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3814  Cytochrome-c3 hydrogenase  80.49 
 
 		 1809 bp  406  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344269  normal  0.0147903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2625  cytochrome-c3 hydrogenase  83.74 
 
 		 1803 bp  285  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.712826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2492  hydrogen:quinone oxidoreductase  79.13 
 
 		 1791 bp  280  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.44509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4594  Cytochrome-c3 hydrogenase  86.22 
 
 		 1794 bp  226  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1942  hydrogen:quinone oxidoreductase  85.71 
 
 		 1794 bp  208  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08120  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  83.5 
 
 		 1806 bp  204  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2541  Cytochrome-c3 hydrogenase  84.92 
 
 		 1782 bp  141  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  100 
 
 		 2043 bp  50.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>