More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0580 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0580  integrase, catalytic region  100 
 
 
85 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  100 
 
 
273 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
358 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  95.95 
 
 
345 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  94.23 
 
 
250 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  63.24 
 
 
297 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  47.14 
 
 
263 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  43.24 
 
 
279 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  41.89 
 
 
280 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  36.49 
 
 
278 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  44.59 
 
 
195 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  44.59 
 
 
195 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3519  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.696579 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  41.56 
 
 
286 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  35.14 
 
 
278 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  35.14 
 
 
278 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  40.54 
 
 
267 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  37.84 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  40.54 
 
 
271 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  40.54 
 
 
267 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  37.84 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1523  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3877  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2133  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1005  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2073  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0312  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0097322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  42.25 
 
 
284 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0006  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0125  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1610  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  40.54 
 
 
277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>