48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0986 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0986  DNA ligase domain-containing protein  100 
 
 		 385 aa  769    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  28.86 
 
 		 584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  29.53 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.2 
 
 		 550 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  28.35 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  26.21 
 
 		 546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  28.88 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.97 
 
 		 590 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27 
 
 		 552 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  27.37 
 
 		 603 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.38 
 
 		 556 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  24.24 
 
 		 568 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  27.75 
 
 		 601 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.13 
 
 		 588 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.37 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.16 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.57 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.94 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.91 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.37 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  23.78 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.23 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  26.63 
 
 		 549 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23 
 
 		 553 aa  66.2  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.49 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.81 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.39 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.39 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  24 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  25.58 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.51 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.53 
 
 		 610 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.62 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.08 
 
 		 592 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.67 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  24.84 
 
 		 513 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  24.45 
 
 		 508 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  25.9 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  24.51 
 
 		 719 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.52 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  22.62 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  21.79 
 
 		 576 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  23.8 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  22.13 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  25.79 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  23.43 
 
 		 534 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  24.15 
 
 		 539 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  21.79 
 
 		 541 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>