37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0397 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0397  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 		 332 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 		 332 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  40 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.77 
 
 		 670 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  31.52 
 
 		 544 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 		 672 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 777 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 339 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  29.11 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  38.36 
 
 		 668 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  34.29 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.12 
 
 		 663 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 		 747 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  30.86 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  38.36 
 
 		 693 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0703  TrkA-C domain protein  36.05 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.308951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  34.57 
 
 		 624 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  47.06 
 
 		 655 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  39.51 
 
 		 592 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  37.04 
 
 		 401 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5115  hypothetical protein  29.03 
 
 		 561 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.44003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4236  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03568  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4048  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.926821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03512  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0018  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 568 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4191  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3896  hypothetical protein  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  29.23 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0019  YidE/YbjL duplication  29.03 
 
 		 553 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.91 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  35.38 
 
 		 352 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  41.38 
 
 		 405 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>