20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3580 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  46.3 
 
 		 549 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  46.77 
 
 		 597 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  42.65 
 
 		 584 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  44.72 
 
 		 578 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  44.72 
 
 		 601 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  43.33 
 
 		 578 aa  79.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  42.31 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  39.05 
 
 		 551 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  37.17 
 
 		 569 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  38.89 
 
 		 558 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  37.72 
 
 		 576 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  37.62 
 
 		 552 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  39 
 
 		 549 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  35 
 
 		 562 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  33 
 
 		 565 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.93 
 
 		 537 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 		 485 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  27.87 
 
 		 542 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>