More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2644 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  70.06 
 
 
478 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0746  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  68.71 
 
 
479 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265352  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3272  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  68.5 
 
 
473 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.967783  normal  0.83445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4282  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  69.08 
 
 
479 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4284  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  69.47 
 
 
480 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  68.15 
 
 
476 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  70.28 
 
 
478 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  71.13 
 
 
478 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.88 
 
 
471 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4893  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  69.49 
 
 
478 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.455192  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2859  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  70.55 
 
 
466 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  68.92 
 
 
480 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1472  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  72.03 
 
 
466 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0943  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.23 
 
 
476 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1087  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.23 
 
 
476 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4955  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  67.94 
 
 
477 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  69.43 
 
 
482 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2529  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  69.49 
 
 
471 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  69.43 
 
 
488 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  70.06 
 
 
478 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2644  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  100 
 
 
474 aa  950    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3153  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.14 
 
 
466 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4648  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  68.02 
 
 
479 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3130  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.74 
 
 
467 aa  631  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0391  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  66.6 
 
 
467 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.45959e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0412  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  66.6 
 
 
467 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  hitchhiker  0.0000241042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0400  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  66.6 
 
 
467 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.603816  hitchhiker  5.12206e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0454  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  66.6 
 
 
467 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.84306  hitchhiker  0.00000000000000419123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0394  cyanide-insensitive oxidase CioA  66.6 
 
 
467 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4101  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.95 
 
 
483 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2131  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  68.66 
 
 
468 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.566764  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.6 
 
 
444 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3573  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
444 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0914  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
444 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000387  putative Cytochrome bd2 subunit I  67.2 
 
 
457 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  62.9 
 
 
535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4853  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.58 
 
 
470 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  0.189641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3376  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.83 
 
 
444 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  63.91 
 
 
470 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3449  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
444 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  63.62 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0928  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.07 
 
 
446 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177592  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.62 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5120  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.44 
 
 
465 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.204733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.35 
 
 
470 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5383  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  63.35 
 
 
559 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0964  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.07 
 
 
446 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.694189  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  63.4 
 
 
470 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1810  putative cytochrome oxidase subunit I  63.69 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0119  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.53 
 
 
462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0836  ubiquinol oxidase family protein  63.81 
 
 
592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0222344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1770  ubiquinol oxidase family protein  63.92 
 
 
617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5724  hypothetical protein  64.45 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1127  ubiquinol oxidase family protein  63.95 
 
 
470 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1835  ubiquinol oxidase family protein  63.95 
 
 
470 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00477233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2100  ubiquinol oxidase family protein  63.95 
 
 
470 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0428  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  63.95 
 
 
470 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0335  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  63.95 
 
 
470 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2148  ubiquinol oxidase family protein  63.52 
 
 
553 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3840  putative cytochrome oxidase subunit I  63.96 
 
 
462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.354412  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6552  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.29 
 
 
466 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6968  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.52 
 
 
466 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6443  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.29 
 
 
466 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.470691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0171  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.91 
 
 
471 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6192  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.08 
 
 
462 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1422  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.06 
 
 
491 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6407  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.06 
 
 
491 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000807  putative Cytochrome bd2 subunit I  58.17 
 
 
462 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7066  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.83 
 
 
466 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4010  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  60.31 
 
 
467 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0416  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  59.06 
 
 
468 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1787  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.56 
 
 
481 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3593  cytochrome ubiquinol oxidase subunit 1 transmembrane protein  59.34 
 
 
472 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0708  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I (cydA, QxtA)  59.57 
 
 
470 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0092  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.52 
 
 
469 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5400  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  61.52 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165282  normal  0.0810428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0560  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.82 
 
 
476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5685  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.29 
 
 
466 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.962592  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5279  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.39 
 
 
468 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4670  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.24 
 
 
468 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3858  hypothetical protein  60.95 
 
 
465 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.84507  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3333  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.69 
 
 
478 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1025  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  59.02 
 
 
473 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4072  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  56.32 
 
 
473 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508302  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3952  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.06 
 
 
465 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0206665  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3927  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  54.49 
 
 
465 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3212  quinol oxidase subunit I QxtA  58.28 
 
 
465 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4927  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.39 
 
 
472 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000735116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2425  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.52 
 
 
480 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1615  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  52.89 
 
 
484 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4323  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.19 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3834  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  56.98 
 
 
474 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4378  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.39 
 
 
468 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4143  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.21 
 
 
474 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  52.2 
 
 
482 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  55.31 
 
 
507 aa  484  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02214  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I  54.08 
 
 
466 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  52.66 
 
 
497 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5132  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.67 
 
 
474 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1976  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  52.97 
 
 
471 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00947535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>