More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1771 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0047  ATPase central domain-containing protein  60.57 
 
 		 608 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2165  ATPase  68.61 
 
 		 560 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0262  AAA family ATPase  69.34 
 
 		 558 aa  809    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.673428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18070  ATPase, AAA superfamily  64.23 
 
 		 585 aa  744    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2338  ATPase central domain-containing protein  63.01 
 
 		 571 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1175  ATPase central domain-containing protein  65.18 
 
 		 574 aa  787    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700331  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1499  ATPase, AAA family  67.21 
 
 		 553 aa  754    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.790722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1217  AAA ATPase central domain protein  66.84 
 
 		 565 aa  765    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000255374  hitchhiker  0.0000000181039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  56.33 
 
 		 567 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1771  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 570 aa  1171    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  39.96 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4172  AAA ATPase, central region  39.55 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6755  ATPase central domain-containing protein  42.83 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4152  AAA ATPase central domain protein  35.7 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  31.89 
 
 		 822 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01591  conserved hypothetical protein  48.12 
 
 		 924 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181362  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677221 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  38.78 
 
 		 753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03615  conserved hypothetical protein  43.37 
 
 		 1049 aa  120  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.391595  normal  0.0454206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  30.84 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  30.11 
 
 		 743 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.6 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  35.62 
 
 		 772 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  30 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.28 
 
 		 744 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  28.31 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  30.27 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  28.57 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  31.84 
 
 		 432 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  25.6 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  29.65 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.45 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  29.76 
 
 		 1193 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  31.09 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  36 
 
 		 766 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  30.48 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  31.51 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.8 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  31.91 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  31.91 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  33.78 
 
 		 771 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  26.03 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.68 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  31.87 
 
 		 775 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  29.7 
 
 		 652 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  30 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  30.86 
 
 		 771 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  29.58 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  32.88 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.6 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  33.7 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  27.23 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  32.64 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  28.81 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  26.55 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  27.88 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  30.28 
 
 		 1085 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  26.64 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  28.15 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  33.7 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  30.94 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.26 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  30.41 
 
 		 671 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  27.22 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  30.39 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  26.2 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  35.83 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  31.16 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  31.72 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  28.21 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  31.39 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  30.56 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  27.65 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  29.14 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.01 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  23.11 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  28.72 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  31.65 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  30.5 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  31.49 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  29.26 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.58 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  22.04 
 
 		 570 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  31.71 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  30.97 
 
 		 336 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 753 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  21.93 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  30 
 
 		 789 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>