16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1584 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1584  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5949  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5311  hypothetical protein  39.89 
 
 		 201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2715  hypothetical protein  40.43 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5007  hypothetical protein  38.3 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536268  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0024  hypothetical protein  36.76 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1852  hypothetical protein  33.86 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2187  hypothetical protein  33.86 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0310445  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1935  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3947  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0213585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2588  hypothetical protein  32.61 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1246  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0031  hypothetical protein  36.21 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0472  hypothetical protein  31.28 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0250  hypothetical protein  47.12 
 
 		 127 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66839  normal  0.167361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>