56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0326 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0326  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 		 144 aa  302  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00145038 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3574  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  58.21 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.18 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2821  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.89 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.34 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1840  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.54 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798586  normal  0.240936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3339  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.15 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4277  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.06 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2241  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.76 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0256  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2465  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0741  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2693  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.45 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0919  hypothetical protein  26.83 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2384  hypothetical protein  26.83 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4111  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000937447  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5412  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.59 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.64 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.89 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.89 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.77 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3500  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.22 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.95 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  34.25 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.8 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.05 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.89 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.27 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.01 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  22.61 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1514  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.95 
 
 		 149 aa  43.5  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  23.21 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  36.62 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00259614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.45 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.69 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2041  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.43 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000392642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.03 
 
 		 130 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  36.62 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.01 
 
 		 119 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.14 
 
 		 134 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.95 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.16 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  26.28 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.28 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.12 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.8 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.67 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  34.67 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4408  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.44 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>