15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0033 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 100 bp  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 104 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 123 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 103 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 110 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 102 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 98 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 98 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 100 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>