35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2259 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1263  protein of unknown function DUF100  79.63 
 
 
382 aa  656    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2259  D-fructose 1,6-bisphosphatase  100 
 
 
383 aa  785    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0196  hypothetical protein  66.85 
 
 
368 aa  518  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0432  protein of unknown function DUF100  61.04 
 
 
371 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1181  hypothetical protein  59.1 
 
 
399 aa  464  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0133  hypothetical protein  60.27 
 
 
399 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.577746  normal  0.0224851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0141  hypothetical protein  58.9 
 
 
406 aa  464  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2049  hypothetical protein  59.05 
 
 
385 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3026  hypothetical protein  58.5 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0111  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.14 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.150469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0665  protein of unknown function DUF100  59.72 
 
 
378 aa  458  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1034  D-fructose 1,6-bisphosphatase  59.4 
 
 
365 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000176813  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0634  hypothetical protein  56.22 
 
 
383 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.372461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1319  hypothetical protein  56.22 
 
 
383 aa  454  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1328  hypothetical protein  58.94 
 
 
383 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.328704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1563  hypothetical protein  58.01 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1151  hypothetical protein  61.25 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1357  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.22 
 
 
383 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1225  hypothetical protein  58.04 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000218903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1839  hypothetical protein  56.42 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0128949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1859  protein of unknown function DUF100  58.06 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.792166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1007  fructose 1,6-bisphosphatase  58.04 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1538  hypothetical protein  56.91 
 
 
371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000224376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.72 
 
 
379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0748752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0607  protein of unknown function DUF100  56.87 
 
 
381 aa  441  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1333  hypothetical protein  55.56 
 
 
371 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1612  hypothetical protein  54.02 
 
 
365 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.160162 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0171  hypothetical protein  51.72 
 
 
383 aa  423  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2722  D-fructose 1,6-bisphosphatase  43.29 
 
 
365 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1035  hypothetical protein  42.86 
 
 
381 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0625  hypothetical protein  37.86 
 
 
382 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1562  fructose-1,6-bisphosphatase  37.6 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0797  protein of unknown function DUF100  33.63 
 
 
298 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.824742  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0221  fructose 1 6-bisphosphatase-like protein  45.45 
 
 
83 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1327  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372464  normal  0.720842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>