18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1605 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1605  peroxiredoxins-like protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.438042  normal  0.500457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1331  conserved hypothetical protein  61.65 
 
 
133 aa  155  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.238415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0100  hypothetical protein  34.09 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  35.61 
 
 
193 aa  77.4  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0092  hypothetical protein  35.61 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.741351  normal  0.223758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  26.14 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  24.82 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.67 
 
 
817 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.97 
 
 
938 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.65 
 
 
864 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3179  hypothetical protein  23.26 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  0.169697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.85 
 
 
817 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  27.15 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  25.83 
 
 
158 aa  42.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  25.36 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  22.3 
 
 
820 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  23.84 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  21.85 
 
 
158 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>