More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1298 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0932  Aldehyde Dehydrogenase  63.2 
 
 
509 aa  676    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.872385  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0979  aldehyde dehydrogenase  63.53 
 
 
513 aa  669    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1298  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
504 aa  1013    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0554  aldehyde dehydrogenase  57.69 
 
 
476 aa  554  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000239131  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  34.59 
 
 
494 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  35.33 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.33 
 
 
482 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  34.92 
 
 
464 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  34.17 
 
 
476 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  32.56 
 
 
479 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  31.92 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  33.89 
 
 
475 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.26 
 
 
471 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  32.78 
 
 
477 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.16 
 
 
477 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  31.37 
 
 
475 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  32.77 
 
 
481 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.09 
 
 
479 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  32.36 
 
 
477 aa  240  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  30.77 
 
 
477 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 
473 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.19 
 
 
475 aa  236  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.95 
 
 
479 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  34.13 
 
 
466 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  34.15 
 
 
489 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.68 
 
 
479 aa  236  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.95 
 
 
479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  32.68 
 
 
472 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  31.92 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.95 
 
 
479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.74 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.95 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  31.71 
 
 
474 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  31.71 
 
 
474 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  31.71 
 
 
474 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  31.71 
 
 
474 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.74 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.54 
 
 
479 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.54 
 
 
479 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  31.5 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  35.24 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  30.75 
 
 
472 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 
457 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
506 aa  233  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.54 
 
 
479 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  30.04 
 
 
484 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  31.24 
 
 
465 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  31.29 
 
 
474 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  34.51 
 
 
475 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  32.25 
 
 
472 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  30.85 
 
 
474 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  31.16 
 
 
480 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
490 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  30.64 
 
 
474 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  30.64 
 
 
474 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  31.85 
 
 
475 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.79 
 
 
477 aa  223  7e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  31.39 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  32.08 
 
 
477 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  31.79 
 
 
469 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.62 
 
 
483 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.62 
 
 
483 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.62 
 
 
483 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  30.33 
 
 
493 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.19 
 
 
483 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.98 
 
 
483 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.41 
 
 
483 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.41 
 
 
483 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.41 
 
 
483 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.41 
 
 
483 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  30.41 
 
 
493 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  31.19 
 
 
465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.41 
 
 
483 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.04 
 
 
483 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  31.38 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  28.94 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  32.53 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.69 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.69 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.96 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.69 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  31.21 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  31.21 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  31.21 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  30.95 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  31.21 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.69 
 
 
482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.75 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.9 
 
 
482 aa  213  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.62 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  30.15 
 
 
481 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  30.75 
 
 
482 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.45 
 
 
485 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  30.6 
 
 
490 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.51 
 
 
484 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.56 
 
 
483 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.59 
 
 
486 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  29.49 
 
 
491 aa  211  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>