More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1287 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.09 
 
 
267 aa  432  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
276 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000532523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
279 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
305 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
278 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
278 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
277 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
285 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
271 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
255 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
282 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
281 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
281 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
274 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  30.69 
 
 
275 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
286 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
276 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
276 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
282 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
277 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
272 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
275 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
285 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
275 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
276 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  29 
 
 
274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
277 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
279 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
285 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
284 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
277 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
272 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072806  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
275 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.78 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
306 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
311 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
299 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.31 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
271 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
275 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
283 aa  99  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
271 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
289 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  28.68 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7335  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.31 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0398278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
293 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
276 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265711  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939147  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
294 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
281 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
280 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
265 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0908154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
288 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
283 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  27.97 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0715797  normal  0.139335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
404 aa  92.4  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
266 aa  92  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  30.53 
 
 
306 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
271 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4518  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
275 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0534801  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11262  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugB  29.6 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  26.67 
 
 
295 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01830  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.21 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>