More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0021 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0021  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2893 bp  5735    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000272892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0006  23S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 2881 bp  1974    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0316316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0053  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2893 bp  5735    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00828042  normal  0.0734628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0056  23S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 2881 bp  1974    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.040674  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0066  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2885 bp  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0008  23S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 2890 bp  737    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  decreased coverage  0.00656926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0043  23S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 2890 bp  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363579  decreased coverage  0.0035918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0063  23S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 2890 bp  737    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0021  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2902 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0081  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2902 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0170  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2902 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0183  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2902 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0411  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2902 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1782  23S ribosomal RNA  84.16 
 
 		 2901 bp  373  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2903 bp  357  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0056  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2904 bp  353  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0050  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2904 bp  353  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0023  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0220545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0004  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180219  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0036  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2904 bp  353  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0055  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0018  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2904 bp  353  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0028  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2925 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0156904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 3116 bp  339  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2909 bp  337  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  83.27 
 
 		 2908 bp  337  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2935 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2932 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2933 bp  333  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0025  23S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 2942 bp  331  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0030  23S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 2942 bp  331  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0014  23S ribosomal RNA  86.16 
 
 		 2942 bp  331  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2926 bp  329  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2851 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2912 bp  329  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2912 bp  329  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2911 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2912 bp  329  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2908 bp  329  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000705814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2909 bp  329  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>