17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1173 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  58.15 
 
 
238 aa  250  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  34.97 
 
 
170 aa  88.2  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  38.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0188  hypothetical protein  30.39 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.55512 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  30.85 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  38.66 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  38.66 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  33.07 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  31.62 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  26.55 
 
 
167 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  31.36 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  30.09 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  32.46 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  25.44 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  27.19 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  27.12 
 
 
242 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>