More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4876 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4876  major facilitator transporter  100 
 
 
465 aa  864    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
458 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
456 aa  196  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  34.7 
 
 
485 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  34.78 
 
 
487 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  34.25 
 
 
485 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  34.62 
 
 
487 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  34.62 
 
 
487 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  34.4 
 
 
487 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.56 
 
 
485 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.11 
 
 
492 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.29 
 
 
475 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.29 
 
 
475 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  27.85 
 
 
472 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  27.99 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  27.99 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  27.99 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  27.38 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  29.23 
 
 
469 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
488 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.67 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.14 
 
 
479 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
473 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
494 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.89 
 
 
487 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  28.38 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
479 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  30.43 
 
 
466 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  28.57 
 
 
487 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
435 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  30.24 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  29 
 
 
472 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  29.01 
 
 
482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  29 
 
 
472 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  29 
 
 
472 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  29 
 
 
472 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  29.06 
 
 
472 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28.78 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  31.63 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.68 
 
 
479 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.15 
 
 
465 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.39 
 
 
479 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.65 
 
 
471 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30 
 
 
461 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  29.82 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
477 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  27.07 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.72 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 
462 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  28.33 
 
 
473 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.27 
 
 
462 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  29.47 
 
 
494 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.25 
 
 
450 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.79 
 
 
462 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.67 
 
 
462 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.46 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  28.1 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  28.1 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.88 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
473 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.63 
 
 
455 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  26.7 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.87 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.05 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  28.79 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  28.27 
 
 
459 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  28.27 
 
 
459 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.05 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
448 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.9 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  28.57 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.02 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  28.57 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  28.35 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.55 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
447 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.07 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  25.94 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.84 
 
 
480 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
472 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.21 
 
 
477 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.84 
 
 
480 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  26.54 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.27 
 
 
459 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>