19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4496 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4496  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3622  hypothetical protein  42.15 
 
 
328 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.453951  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  43.35 
 
 
330 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3499  hypothetical protein  64.62 
 
 
340 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  53.66 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  60.94 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1675  hypothetical protein  44.57 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  49.12 
 
 
393 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  25.27 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  26.35 
 
 
305 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  40.54 
 
 
334 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0055  hypothetical protein  37.93 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  28.95 
 
 
3521 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  28.1 
 
 
3409 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.05 
 
 
3472 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  29.05 
 
 
3471 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  38.96 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.21 
 
 
2449 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  40.35 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>