More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4444 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.42 
 
 
264 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
265 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  58.75 
 
 
265 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  58.37 
 
 
265 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.41 
 
 
270 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
271 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
270 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
271 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
266 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.98 
 
 
264 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
266 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
281 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
281 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
266 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
265 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.29 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 
285 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.91 
 
 
266 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
266 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
269 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
269 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.14087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
271 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
269 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.64 
 
 
269 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.590645  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
262 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.17 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.37 
 
 
262 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.92 
 
 
269 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 
265 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.09 
 
 
270 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
262 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
262 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
261 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.92 
 
 
266 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
260 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
266 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  49.62 
 
 
264 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.11 
 
 
265 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50.2 
 
 
262 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.36 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 
262 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
257 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
260 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
262 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
266 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
267 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
266 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.09 
 
 
268 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
263 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.63 
 
 
296 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
253 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.63 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0343056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
259 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
269 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
269 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
255 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
252 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
258 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
258 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
255 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
255 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.22 
 
 
258 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
263 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
250 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.44 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
271 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
258 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
249 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.43 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
263 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  40 
 
 
266 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
250 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
262 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
271 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.97 
 
 
282 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
258 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  34.36 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  40.62 
 
 
267 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>