More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2887 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
369 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.24 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.874263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.52 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.6 
 
 
373 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.84 
 
 
379 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6091  cyclic nucleotide-binding protein  58.86 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
353 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.28935  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.77 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  0.0491821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.659828 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161422  normal  0.279284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.28 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 
386 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 
386 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 
377 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  50.56 
 
 
379 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
379 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  48.3 
 
 
373 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.45 
 
 
299 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.9 
 
 
302 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.8 
 
 
308 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  58.95 
 
 
293 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.53 
 
 
301 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  56.68 
 
 
300 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  56.68 
 
 
302 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 
300 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 
301 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  56.68 
 
 
300 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  51.74 
 
 
302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  51.74 
 
 
302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  51.74 
 
 
302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  51.74 
 
 
302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  46.58 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.21 
 
 
296 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  58.18 
 
 
300 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
302 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.8 
 
 
304 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  59.55 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  59.09 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  55.36 
 
 
304 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
300 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  59.09 
 
 
300 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.17 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55 
 
 
305 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 
305 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  48.64 
 
 
310 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
301 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.32 
 
 
302 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 
317 aa  225  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1895  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  57.27 
 
 
301 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.213821  normal  0.110744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2161  oligopeptide transport system permease  55.23 
 
 
301 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00516752  normal  0.0301341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 
301 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1958  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  55.23 
 
 
301 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.39 
 
 
307 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.39 
 
 
307 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.89 
 
 
302 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01219  oligopeptide transporter subunit  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0051729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01229  hypothetical protein  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239558  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.77 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1731  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  56.82 
 
 
301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1425  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1414  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.585769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135484 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1354  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1393  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  56.82 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 
260 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.73 
 
 
302 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0767914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 
302 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
340 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
496 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.09 
 
 
479 aa  205  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
310 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
485 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 
495 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 
494 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.75 
 
 
497 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
310 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  44.75 
 
 
473 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
283 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
285 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  45.91 
 
 
288 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  31.28 
 
 
349 aa  195  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  42.47 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
356 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.47 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
280 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>