62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2273 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2273  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  31.75 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  32.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2271  hypothetical protein  35.63 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0577348  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  38.27 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  27.84 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  33.63 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2092  hypothetical protein  32.29 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1992  protein of unknown function DUF937  31.78 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  29.21 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  29.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  31.86 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  29.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  29.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  29.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  28.26 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3368  protein of unknown function DUF937  31.62 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2166  protein of unknown function DUF937  34.62 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2353  hypothetical protein  28.87 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  33.8 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1654  hypothetical protein  31.18 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469031  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  36.59 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.465593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6527  hypothetical protein  31.94 
 
 		 217 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581879  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  28.17 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2217  protein of unknown function DUF937  28.04 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3910  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03525  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.998118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0005  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4207  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0005  protein of unknown function DUF937  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03581  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2844  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0722  protein of unknown function DUF937  28.75 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.888742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1984  hypothetical protein  30.7 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  28.74 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  32.5 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2984  hypothetical protein  34.21 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  31.17 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1957  protein of unknown function DUF937  30 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0191237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  30 
 
 		 186 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4227  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0112  hypothetical protein  24.37 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00850654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5279  protein of unknown function DUF937  28 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0199  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  31.17 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0434  hypothetical protein  24.66 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3003  protein of unknown function DUF937  38.67 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5126  hypothetical protein  29.07 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.20781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4053  hypothetical protein  27.14 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4423  protein of unknown function DUF937  27.14 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6724  protein of unknown function DUF937  29.17 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0545  hypothetical protein  24.66 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4535  protein of unknown function DUF937  28.17 
 
 		 225 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>