More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1275 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.4 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.92 
 
 
266 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.17 
 
 
281 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.17 
 
 
281 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.9 
 
 
266 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.3 
 
 
266 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.3 
 
 
266 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.3 
 
 
266 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.43 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.22 
 
 
270 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  57.36 
 
 
264 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.77 
 
 
265 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61 
 
 
266 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.39 
 
 
285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.65 
 
 
270 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.06 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.14087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.54 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
270 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
270 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.58 
 
 
269 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.13 
 
 
269 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
262 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
262 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.53 
 
 
266 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.23 
 
 
269 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 
265 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  57.36 
 
 
265 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  56.2 
 
 
265 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
265 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
267 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.51 
 
 
269 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.590645  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.65 
 
 
266 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.72 
 
 
264 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
260 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
261 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
262 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.34 
 
 
264 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
262 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
264 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
260 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.48 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.11 
 
 
264 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
266 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
266 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.45 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
266 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
262 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
267 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 
268 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
262 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
257 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
287 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
199 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0343056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
263 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
264 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241971  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
283 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
259 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
255 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
269 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
253 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.11 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
271 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
269 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.55 
 
 
296 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
255 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
271 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.23 
 
 
249 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
276 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
269 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  37.55 
 
 
266 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.18 
 
 
252 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
269 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
259 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
255 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
264 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
262 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.99 
 
 
266 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
262 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  37.67 
 
 
267 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
249 aa  131  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
263 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
259 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>