31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1240 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1240  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  100 
 
 		 65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0126  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441764  normal  0.0459819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2317  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1597  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  43.64 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2495  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  39.66 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3148  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  39.66 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3067  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  40.98 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00103441  hitchhiker  0.00858929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1572  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.291766  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2589  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  40.38 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3823  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  44 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4343  hypothetical protein  42 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4151  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  41.07 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3373  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  42.37 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3118  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  39.29 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5279  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  44 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5918  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  44 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.847004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0630  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  40 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3231  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  37.25 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2536  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  33.93 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137211  normal  0.503574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0276  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2866  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  34.62 
 
 		 179 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0893299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0622  hypothetical protein  37.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2252  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  42 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0605  hypothetical protein  37.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3109  polyhydroxyalkonate synthesis repressor, PhaR  42.86 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3059  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.86 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7615  putative polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR-like protein  42.86 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3687  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.86 
 
 		 203 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1951  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1359  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.71 
 
 		 183 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0307  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.86 
 
 		 202 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724282  normal  0.278491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>