54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1053 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  67.74 
 
 
125 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  67.5 
 
 
124 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  64.22 
 
 
124 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  63.3 
 
 
124 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  56.2 
 
 
124 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  57.5 
 
 
125 aa  150  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  54.55 
 
 
124 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  55.37 
 
 
124 aa  146  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  55.2 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  53.72 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  61.9 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  55.83 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  52 
 
 
125 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  52.8 
 
 
125 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  62.96 
 
 
124 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  52 
 
 
125 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  53.33 
 
 
124 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  53.33 
 
 
124 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  46.4 
 
 
125 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  50.79 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  50.42 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  51.59 
 
 
126 aa  134  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  51.2 
 
 
125 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  51.26 
 
 
125 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  48.8 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  49.17 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  44.35 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  48.48 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  46.6 
 
 
125 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  39.64 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  44.14 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  39.64 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  41.58 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  44.58 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  32.26 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  43.02 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  57.38 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  40 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  28.57 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>