More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0886 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0886  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
328 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0420  riboflavin biosynthesis protein RibF  72.5 
 
 
355 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.506941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0490  riboflavin biosynthesis protein RibF  72.59 
 
 
337 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74027  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0453  riboflavin biosynthesis protein RibF  72.81 
 
 
337 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118027  normal  0.166197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2222  riboflavin biosynthesis protein RibF  69.62 
 
 
321 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0389  riboflavin biosynthesis protein RibF  72.15 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1717  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  52.09 
 
 
326 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00388898  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3161  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.92 
 
 
327 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4040  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.5 
 
 
322 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2541  riboflavin kinase / FAD synthetase  52.24 
 
 
327 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4186  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.5 
 
 
322 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1399  riboflavin biosynthesis protein RibF  50.17 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.804257  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4863  riboflavin biosynthesis protein RibF  49.17 
 
 
322 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  49.83 
 
 
315 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0180  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  49.83 
 
 
329 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.01321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.94 
 
 
316 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1327  riboflavin biosynthesis protein RibF  49.23 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.586967  normal  0.980544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3030  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  48.5 
 
 
329 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0473  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  49.83 
 
 
327 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.184681  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0518  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  49.83 
 
 
327 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.827373  normal  0.357922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  50.33 
 
 
330 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0682  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.13 
 
 
329 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303774 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5826  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  45.98 
 
 
326 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0411  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  48.51 
 
 
327 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1163  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.23 
 
 
330 aa  245  8e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3785  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  46.2 
 
 
313 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0688887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  47.18 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2965  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  45.63 
 
 
317 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0760879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.92 
 
 
309 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.47 
 
 
309 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.55 
 
 
312 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.39 
 
 
313 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  43.49 
 
 
317 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.86 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0612  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.26 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.115533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.27 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.07 
 
 
311 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  46.53 
 
 
306 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.25 
 
 
312 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  40.07 
 
 
328 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3365  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  43.67 
 
 
307 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2071  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  43.81 
 
 
310 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.275327  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.97 
 
 
320 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  41.97 
 
 
345 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.18 
 
 
314 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  39.74 
 
 
328 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  42.47 
 
 
309 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.57 
 
 
308 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  43.92 
 
 
306 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00012  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.99 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000105637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.58 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.13 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0861  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.67 
 
 
322 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.204041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3227  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.78 
 
 
303 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1124  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  44.03 
 
 
315 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.59 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  40 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.26 
 
 
311 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.99 
 
 
312 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.5 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.7 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.89 
 
 
311 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.61 
 
 
313 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.75 
 
 
311 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.76 
 
 
306 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.35 
 
 
311 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.57 
 
 
311 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1522  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.22 
 
 
315 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.332589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.86 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.03 
 
 
322 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.22 
 
 
315 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.84 
 
 
312 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.86 
 
 
311 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.39 
 
 
311 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.42 
 
 
320 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.6 
 
 
322 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0583  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.03 
 
 
309 aa  192  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.73 
 
 
311 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.95 
 
 
320 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.66 
 
 
310 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.91 
 
 
313 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.41 
 
 
294 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.86 
 
 
311 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.34 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.5 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.16 
 
 
308 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.45 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.5 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  40 
 
 
311 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.16 
 
 
311 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.16 
 
 
311 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40.07 
 
 
306 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.16 
 
 
311 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.67 
 
 
309 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.49 
 
 
311 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.46 
 
 
325 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>