21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4022 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4022  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  90.39 
 
 		 225 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4061  hypothetical protein  91.27 
 
 		 225 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.507546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1308  hypothetical protein  71.24 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5183  hypothetical protein  74.42 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  36.11 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  29.5 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  31.73 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  26.73 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  29.03 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  39.74 
 
 		 163 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  24.75 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  27.16 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  22.58 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 166 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>