More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2357 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  89.78 
 
 		 678 aa  1167    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 685 aa  1367    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  51.12 
 
 		 663 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  48.97 
 
 		 668 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  46.07 
 
 		 666 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  45.38 
 
 		 658 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  43.73 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  43.28 
 
 		 886 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  42.45 
 
 		 864 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  42.99 
 
 		 858 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.49 
 
 		 844 aa  446  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  45.49 
 
 		 833 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  44.19 
 
 		 834 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  42.64 
 
 		 787 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 		 859 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  40.49 
 
 		 868 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  39.85 
 
 		 884 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  40.28 
 
 		 848 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  40.03 
 
 		 824 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  39.88 
 
 		 862 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 837 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  39.88 
 
 		 862 aa  431  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  41.6 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  39.48 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  41.15 
 
 		 911 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  39.76 
 
 		 925 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  41.84 
 
 		 914 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.84 
 
 		 866 aa  429  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  43.24 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  39.33 
 
 		 871 aa  429  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  41.28 
 
 		 912 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  39.33 
 
 		 871 aa  429  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 		 840 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 		 845 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  42.67 
 
 		 837 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  43.59 
 
 		 836 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  41.84 
 
 		 914 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.09 
 
 		 842 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  38.91 
 
 		 929 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  39.76 
 
 		 910 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  42.12 
 
 		 914 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  40.37 
 
 		 1200 aa  426  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  39.11 
 
 		 926 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  42.46 
 
 		 845 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  40.54 
 
 		 868 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  43.08 
 
 		 830 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 863 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 799 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  43.58 
 
 		 836 aa  426  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  41.46 
 
 		 914 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  43.43 
 
 		 840 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  40.6 
 
 		 934 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  41.43 
 
 		 881 aa  421  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.1 
 
 		 912 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 835 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 835 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 835 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  41.31 
 
 		 909 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  39.91 
 
 		 934 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 835 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 835 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 901 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  41.36 
 
 		 910 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  42.27 
 
 		 933 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 		 901 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  40.65 
 
 		 844 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  42.36 
 
 		 835 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  40.48 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  38.65 
 
 		 853 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  40.42 
 
 		 923 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  40.03 
 
 		 912 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 		 901 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 		 901 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  42.36 
 
 		 835 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  40.83 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 		 901 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  42.18 
 
 		 835 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  42.17 
 
 		 930 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  40.62 
 
 		 920 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  41.48 
 
 		 981 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  38.61 
 
 		 862 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 		 901 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 		 901 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  40.13 
 
 		 890 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  39.71 
 
 		 855 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.3 
 
 		 939 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>