21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2258 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2258  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.41821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3420  hypothetical protein  70 
 
 
265 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6380  hypothetical protein  41.38 
 
 
240 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1732  hypothetical protein  38.22 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000872806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2572  hypothetical protein  34.58 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.480736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0028  hypothetical protein  33.7 
 
 
248 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2525  hypothetical protein  32.89 
 
 
207 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1282  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 
211 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1294  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2744  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2663  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2512  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02285  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02246  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.816553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3607  hypothetical protein  33.15 
 
 
211 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3186  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3264  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.394493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3365  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3249  hypothetical protein  28.26 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.202739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3200  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2515  hypothetical protein  25.4 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>