More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0497 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0497  malate dehydrogenase (NAD)  100 
 
 		 432 aa  844    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2341  Lactate/malate dehydrogenase  50.95 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  hitchhiker  0.00418308 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  40.85 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  41.5 
 
 		 310 aa  236  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  39.27 
 
 		 324 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.09 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.03 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.3 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.67 
 
 		 308 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  40.2 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  39.53 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 317 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  38.49 
 
 		 310 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  37.86 
 
 		 309 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  38.92 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  39.67 
 
 		 307 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  39.47 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  39.12 
 
 		 310 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  39.54 
 
 		 316 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  38.73 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.59 
 
 		 326 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  38.49 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  36.81 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  38.36 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  38.03 
 
 		 317 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  38.03 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  36.07 
 
 		 307 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  39.09 
 
 		 312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 316 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 316 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 316 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.09 
 
 		 320 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.09 
 
 		 320 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  36.59 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  38.31 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.87 
 
 		 307 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  37.97 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  37.83 
 
 		 310 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  38.38 
 
 		 308 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  38.76 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  38.26 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.84 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  37.58 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.1 
 
 		 320 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.71 
 
 		 314 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  38.64 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  38.8 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  35.62 
 
 		 308 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  37.91 
 
 		 310 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.8 
 
 		 307 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  34.63 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0615  Lactate/malate dehydrogenase  39.22 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4414  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40 
 
 		 307 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  38.44 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  38.44 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  36.45 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4174  lactate/malate dehydrogenase  42.01 
 
 		 316 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714924  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.46 
 
 		 312 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.89 
 
 		 320 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  35.37 
 
 		 320 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.14 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  34.97 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  35.84 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0387  malate dehydrogenase (NAD)  40.45 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  36.63 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  34.21 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  36.79 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  36.73 
 
 		 338 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  36.73 
 
 		 320 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  34.32 
 
 		 309 aa  193  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.84 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.79 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3794  lactate/malate dehydrogenase  41.32 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.67 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  36.54 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  33.55 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  31.02 
 
 		 313 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  35.12 
 
 		 320 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  35.29 
 
 		 311 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.16 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.75 
 
 		 316 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.57 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.57 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  33.65 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  33.01 
 
 		 313 aa  188  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.87 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  34.64 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.55 
 
 		 312 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.97 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>