More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3692 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3692  ABC type ATPase  100 
 
 		 576 aa  1147    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.27 
 
 		 534 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 620 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  49.83 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.58 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.4 
 
 		 617 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 609 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  45.8 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  43.33 
 
 		 564 aa  487  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  52.46 
 
 		 530 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.83 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.13 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  45.48 
 
 		 583 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.97 
 
 		 571 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  46.64 
 
 		 533 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  48.76 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  47.8 
 
 		 539 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  47.63 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  48.69 
 
 		 547 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  49.29 
 
 		 543 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  43.06 
 
 		 617 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.71 
 
 		 627 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  47.41 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.91 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  45.65 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  49.73 
 
 		 542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  46.22 
 
 		 543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.28 
 
 		 613 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.09 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.44 
 
 		 553 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  47.53 
 
 		 533 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  47.12 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  48.32 
 
 		 537 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  44.25 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  49.56 
 
 		 542 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  46.83 
 
 		 531 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.1 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  47.66 
 
 		 537 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  49.12 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  49.82 
 
 		 527 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  48.67 
 
 		 543 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  50.27 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  47.43 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 550 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  46.73 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.27 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47.01 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.21 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.07 
 
 		 620 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.29 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  47.73 
 
 		 556 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  46.71 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  48.32 
 
 		 537 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.43 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 545 aa  462  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  46.71 
 
 		 623 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.08 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  46.97 
 
 		 612 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.19 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  47 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.75 
 
 		 623 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.88 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  47.99 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.95 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  46.51 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  45.93 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.47 
 
 		 545 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.17 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 		 634 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 632 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.91 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  48.97 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  47.53 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.64 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.63 
 
 		 579 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.17 
 
 		 543 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.44 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  43.83 
 
 		 617 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.59 
 
 		 536 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 625 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  49.55 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 		 649 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 		 634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>