More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3078 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  56.72 
 
 
692 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.87 
 
 
692 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2937  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.97 
 
 
700 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.9 
 
 
684 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.39 
 
 
708 aa  794    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.85 
 
 
709 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.49 
 
 
697 aa  698    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  57.66 
 
 
696 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.67 
 
 
700 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2068  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.7 
 
 
692 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.93 
 
 
699 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.92 
 
 
699 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1209  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.55 
 
 
692 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.2 
 
 
709 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.92 
 
 
699 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1308  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.72 
 
 
692 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.201196 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.9 
 
 
684 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.73 
 
 
699 aa  674    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.72 
 
 
692 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.86 
 
 
692 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.51 
 
 
700 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.35 
 
 
709 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.85 
 
 
694 aa  788    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.85 
 
 
693 aa  827    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  58.42 
 
 
694 aa  768    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.26 
 
 
692 aa  778    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.93 
 
 
709 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.39 
 
 
708 aa  794    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3078  flagellar biosynthesis protein  100 
 
 
700 aa  1392    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.984078  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.73 
 
 
690 aa  720    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.56 
 
 
709 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.57 
 
 
699 aa  1044    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.92 
 
 
699 aa  715    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.69 
 
 
697 aa  715    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.37 
 
 
699 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.93 
 
 
699 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.01 
 
 
700 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.99 
 
 
697 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.57 
 
 
694 aa  1029    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.08 
 
 
692 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.02 
 
 
692 aa  787    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.08 
 
 
709 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2431  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.78 
 
 
692 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  79.54 
 
 
700 aa  1087    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.93 
 
 
699 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.51 
 
 
700 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.31 
 
 
702 aa  694    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.72 
 
 
692 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.08 
 
 
693 aa  1026    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.63 
 
 
755 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.43 
 
 
705 aa  688    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.48 
 
 
699 aa  725    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.44 
 
 
690 aa  818    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.19 
 
 
700 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.12 
 
 
707 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.6 
 
 
699 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.55 
 
 
697 aa  742    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.08 
 
 
699 aa  720    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.45 
 
 
695 aa  764    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1974  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.57 
 
 
692 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.3 
 
 
695 aa  786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2073  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.7 
 
 
692 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000742735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.37 
 
 
700 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.07 
 
 
699 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.51 
 
 
700 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2446  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.93 
 
 
692 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.8 
 
 
700 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.62 
 
 
697 aa  998    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.15 
 
 
748 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.64 
 
 
699 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.64 
 
 
699 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.94 
 
 
706 aa  697    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.9 
 
 
699 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.08 
 
 
700 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2111  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.72 
 
 
692 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.01 
 
 
700 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.83 
 
 
707 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.51 
 
 
700 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2333  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.93 
 
 
692 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.93 
 
 
697 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.35 
 
 
699 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2128  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.7 
 
 
692 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000657418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.28 
 
 
699 aa  720    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.53 
 
 
698 aa  776    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.97 
 
 
715 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1332  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.7 
 
 
692 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.71 
 
 
699 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.48 
 
 
700 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.91 
 
 
724 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.14 
 
 
700 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  73.25 
 
 
693 aa  1042    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.57 
 
 
694 aa  1031    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.72 
 
 
692 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.27 
 
 
700 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>