20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0435 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  235  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  45.65 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  42.48 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  38.6 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  39.66 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  38.39 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  35.78 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  33.94 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  33.94 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  38.39 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  38.71 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  35.96 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  30.93 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  36.21 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  37.11 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  51.06 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  34.33 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>